明治十年，劍心、彌彥、阿薰、左之助一行乘火車來至橫濱，甫至此地，便因與幾個(gè)騷擾年輕女子的外國士兵發(fā)生爭(zhēng)端，且因此結(jié)識(shí)了正直的武士時(shí)雨瀧魁，他們很快成為好朋友。
　　時(shí)政治格局仍動(dòng)蕩不安，諸多反抗明治的志士不斷向政府機(jī)關(guān)以及外國大使館發(fā)動(dòng)襲擊。而時(shí)雨正是所謂“新維新”運(yùn)動(dòng)的領(lǐng)導(dǎo)者，明治以前，他曾是佐幕派彰義隊(duì)的領(lǐng)袖之一，其好友“鬼斬”高槻嚴(yán)達(dá)即死在拔刀齋劍心的刀下，而被他們所搭救的女孩朱鷺正是嚴(yán)達(dá)的女兒。
　　造物弄人，讓這些恩怨糾纏的人以如此方式重逢。得知一切的劍心決定不顧一切阻止好友襲擊政府的行動(dòng)。而另一方面，野心家田母野打算借鎮(zhèn)壓叛亂分子的良機(jī)圖謀不軌……